Certamente, uma das atividades mais atrativas e procuradas durante uma hospedagem em Morro de São Paulo é a prática do mergulho. Há pontos ótimos para a prática, como a Terceira ou Quarta praia, onde você pode experimentar um passeio inspirador entre peixes coloridos e corais ou optar por mergulhos que chegam a vinte e cinco metros de profundidade. O mergulho pode ser feito com cilindro ou de forma livre. Os guias da ilha elegem os meses de outubro até fevereiro como ideais para mergulhar, pois, nesta época, as águas estão mais claras do que nunca.

 Em determinadas praias é possível a prática de kitesurf, windsurf e do surf. A Primeira, a Quarta Praia e a Pedra do Moleque são points dos aventureiros que procuram muita adrenalina em cima de pranchas. Para uma hospedagem mais tranqüila em Morro de São Paulo, é recomendado o acompanhamento de algum conhecedor da região enquanto pratica-se esses esportes, há muitos pontos isolados e de difícil acesso que podem complicar a volta para a praia.
 Há também a tradicional Banana Boat, o aluguel de veleiros, os passeios de escuna em volta da ilha e, como uma ótima opção para apreciar a paisagem, passeios de caiaque para os que têm mais fôlego. Já para os que são corajosos, a dica e enfrentar os 57 metros de altura e 340 metros de comprimento da maior tirolesa do Brasil, que fica entre o Farol e a Primeira Praia.