Uma experiência inesquecível para sua hospedagem em Morro de São Paulo é a observação das baleias jubarte que partem da Antártica para o litoral nordestino em busca de águas mais quentes e tranqüilas para procriação, ambiente essencial à sobrevivência dos recém-nascidos.

 Elas podem ser avistas com seus filhotes em Morro de São Paulo, bem próximas da costa, durante os meses de julho a outubro. Conhecidas por seu temperamento dócil e por um desenvolvido sistema de vocalização, as baleias jubarte realizam saltos, exposições da cabeça e nadadeiras. Em Morro de São Paulo, há agências especializadas neste tipo de passeio, realizado também com o intuito de colaborar com a preservação do mamífero aquático.